Baltijos šalių gamtinių dujų birža organizuoja prekybą trumpalaikiais ir ilgalaikiais gamtinių dujų produktais, prekybos aikštelėse, esančiose Lietuvoje, Latvijoje, Estijoje ir Suomijoje. Prekiauti biržoje gali visi gamtinių dujų rinkos dalyviai, turintys biržos dalyvio statusą.
Prekyba biržoje yra vykdoma anonimiškai, virtualiuose Lietuvos, Latvijos, Estijos ir Suomijos prekybos taškuose, naudojant nepertraukiamos prekybos metodą. Prekyba biržoje yra vykdoma kiekvieną dieną 24/7 (visą parą) trumpalaikiais produktais, nuo 9:00 val. iki 16:00 val. prekyba vykdoma kiekvieną dieną ilgalaikių sandorių rinkoje (žiemos laiku naudojamas EET, o vasaros laiku naudojamas EEST laikai).
Dalyvių teikiami pavedimai apibrėžiami pavedimo rūšies (dalinio, ar pilno įvykdymo), produkto pavadinimo (pagal pristatymo laikotarpį), kainos ir kiekio kriterijais. Taip pat pavedimai gali būti teikiami tik tos šalies prekybos aikštelėje, su kurios perdavimo sistemos operatoriumi dalyvis turi sudaręs gamtinių dujų perdavimo paslaugų sutartį ir (ar) balansavimo sutartį. Pasirinkus dienos prieš parą produktą, pavedimas pirkti/parduoti atvaizduojamas visose trijose Baltijos šalių ir Suomijos prekybos aikštelėse, atsižvelgiant į sujungimo taškuose esančius laisvus pajėgumus.